Nuestro equipamiento nCounter MAX de Nanostring permite analizar cientos de mRNAs, miRNAs, SNV, CNV o proteínas directamente mediante detección molecular digital directa, en una sola reacción en ausencia de enzimas (sin retrotranscripción ni amplificación). Es un sistema de alta sensibilidad y reproducibilidad, con granc apacidad de multiplexado (hasta 800 genes en la misma reacción), lo cual no solo disminuye el número de reacciones necesarias, sino que también supone un ahorro en la cantidad de RNA/DNA que se requiere para el ensayo.
La tecnología que utiliza el NextSeq2000 de Illumina se basa en la secuenciación por síntesis (SBS), donde el seguimiento de los nucleótidos marcados se lleva a cabo de manera simultánea a la copia de la cadena de ADN. Esta tecnología permite secuenciar millones de fragmentos de forma masiva y en paralelo, mejorando la velocidad y la precisión de secuenciación al tiempo que reduce su coste.
El sistema de secuenciación Illumina NextSeq 2000 ha sido provisto con un novedoso sistema óptico de súper resolución que produce datos de imágenes de alta precisión con una mayor resolución y sensibilidad que los sistemas de Illumina más tradicionales.
Disponible la Plataforma Chromium X Single en nuestro servicio NGS
Ventajas de la tecnología10x Genomics:
Opciones disponibles
Hacemos procesado y depuración de datos ómicos. Asesoramos en montaje de pipelines (estándar y adhoc) y desarrollo de software a medida.
Procesado de todo el pipeline de análisis de DNA, desde el FastQ hasta la anotación de variantes. Control de calidad en cualquier punto del proceso.
Análisis de estructura poblacional de grupos de muestras, identificación de marcadores y genes asociados con fenotipos, análisis funcional de pathways y datamining (búsqueda y procesado) de bases de datos en repositorios públicos para análisis alternativos.
Análisis de expresión en plataformas RNA-Seq y Nanostring. Control de calidad, alineamiento y cuantificación de expresión a nivel de gen o tránscrito y anotación. Normalización y análisis de expresión diferencial y análisis funcional de pathways.
Análisis de datos de plataformas Illumina Infinium Methylation 450K y EPIC BeadChip: control de calidad, normalización y detección de posiciones (DMPs) y regiones (DMRs) diferencialmente metiladas en diferentes grupos de muestras. Análisis de pathways de genes asociados con DMPs y DRMs.
